Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms