Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AC130448.1-201ENST00000624179 1733 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCTD12Q96CX2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms