Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2Q8WZ74 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms