Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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