Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms