Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLGALT1Q8NBJ5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms