Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms