Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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