Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q71RC1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q71RC1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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