Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms