Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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