Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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