Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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