Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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GABRA6Q16445 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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GABRA6Q16445 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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GABRA6Q16445 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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GABRA6Q16445 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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GABRA6Q16445 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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