Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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