Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms