Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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