Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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