Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms