Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms