Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms