Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms