Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms