Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMF1P82094 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMF1P82094 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMF1P82094 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMF1P82094 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMF1P82094 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms