Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms