Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ACTBP60709 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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