Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms