Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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