Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NESP48681 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NESP48681 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms