Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms