Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRCC3P46736 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms