Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBX2P40425 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBX2P40425 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBX2P40425 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms