Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms