Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms