Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR4P22455 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms