Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms