Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1P21675 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1P21675 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms