Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRHP20396 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRHP20396 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRHP20396 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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