Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNNT1P13805 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms