Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms