Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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