Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB7P09629 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms