Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGBP02675 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGBP02675 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGBP02675 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms