Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms