Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB3O43889 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms