Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3QRK9 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3QRK9 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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