Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms