Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms