Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms