Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms